Un equipo internacional de investigadores anunció el hallazgo de 12,556 nuevas especies de bacterias y arqueas. Lo hicieron sin necesidad de cultivarlas en un laboratorio con una placa de Petri, instrumento en el que se lleva a cabo este proceso.
Hicieron el descubrimiento utilizando una técnica llamada metagenómica, informó ScienceAlert.
“Pudimos reconstruir miles de genomas ensamblados en metagenomas (MAG) a partir de muestras ambientales secuenciadas”, señaló el genetista Stephen Nayfach, del Instituto Joint Genome de la Universidad de Berkeley.
“Lo que hace que este estudio realmente se destaque con respecto a esfuerzos anteriores es la notable diversidad ambiental de las muestras que analizamos”, agregó.
El equipo tuvo acceso a una enorme base de datos de más de 10,000 metagenomas, material genético obtenido directamente de muestras ambientales.
Con esta técnica, cualquier ADN que puedan extraer se clona y luego se secuencia utilizando pequeñas hebras del genoma. Luego, estos pequeños fragmentos de ADN, se encajan nuevamente.
Para “armar el rompecabezas” los científicos utilizan una técnica llamada “binning”. Con ella, el equipo pudo juntar 52,515 MAG, muchos de ellos de alta calidad y todos con más del 50 por ciento de su genoma completo.
“Realizamos ensamblaje metagenómico y agrupamiento en 10,450 metagenomas de diversos hábitats, incluidos el océano y entornos asociados con huéspedes humanos y animales, así como suelos y otros ambientes terrestres. Recuperamos 52,515 MAG”, escriben los científicos en su informe publicado en la revista Nature.
“El catálogo amplía la diversidad filogenética conocida de bacterias y arqueas en un 44 por ciento”, agrega.
Cuando el equipo verificó los genomas de los elementos aislados, los MAG de estudios anteriores y los genomas de células individuales, encontraron que 12,556 de los 50,000 MAG nunca se habían secuenciado antes.
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